Insectes:
- Gusc de ceba (Delia antiqua)
- Trips (Thrips tabaci)
- Mosca de la ceba (Eumerus spp.)
- Cucs talladors (Agrotis spp.)
- Pugons (Aphis spp.)
Fongs:
- Podridura blanca (Sclerotium cepivorum)
- Mildiu (Peronospora destructor)
- Arrel rosa (Phoma terrestris)
- Podridura basal de Fusarium (Fusarium oxysporum f. sp. cepae)
Virus:
- Virus de la nana groga de la ceba (OYDV)
- Virus de la taca groga de l'iris (IYSV)
- Virus del mosaic de la ceba (OMV)
- Virus del sonall del tabac (TRV)
Altres plagues:
- Nematodes (Ditylenchus dipsaci)
- Àcars del bulb (Rhizoglyphus spp.)
- Rosegadors (com ara campanyes i ratolins)
Val la pena assenyalar que la gravetat i l'impacte d'aquestes plagues poden variar segons la regió i el clima específics, així com les pràctiques de cultiu utilitzades.